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効率的な検索法とPubMedの使い⽅
Efficient search methods and how to use the PubMed
12017/04/24 © 2017 TAKANORI HIROE; DEPARTMENT OF BIOSTATISTICS, KYOTO UNIVERSITY SCHOOL OF PUBLIC HEALTH
京都⼤学⼤学院 医学研究科
Kyoto University Graduate School of Medicine
医療統計学分野 / 医学教育・国際化推進センター
Department of Biostatistics / Center for Medical Education
洛和会⾳⽻病院総合内科 臨床研究指導者(⾮常勤)
廣江 貴則 Takanori Hiroe(t-hiroe[at]umin.ac.jp)
2. Outline
1. PubMedの概要と検索サイト
2. 論理演算⼦の利⽤と検索例
◦ 論理演算⼦と検索式
◦ 検索式を⽤いた検索の例
3. タグを利⽤した検索
◦ タグの使い⽅
◦ タグを⽤いた検索の例
4. MeSH DatabaseとAdvanced Search Builder
2017/04/24 © 2017 TAKANORI HIROE; DEPARTMENT OF BIOSTATISTICS, KYOTO UNIVERSITY SCHOOL OF PUBLIC HEALTH 2
3. Outline
1. PubMedの概要と検索サイト
2. 論理演算⼦の利⽤と検索例
◦ 論理演算⼦と検索式
◦ 検索式を⽤いた検索の例
3. タグを利⽤した検索
◦ タグの使い⽅
◦ タグを⽤いた検索の例
4. MeSH DatabaseとAdvanced Search Builder
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5. PubMedのMain page
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検索窓
Advanced
Search
Builder
6. PubMedの構成
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MEDLINE(1946〜)
Old MEDLINE(〜1945)
Non MEDLINE
こちらがメイン
MeSH(後述)付与
出版社から提供された情報で
MEDLINEに載らないもの
or 準備中のもの
随時更新
約6000誌,9割以上が英語
(実は他の言語もある)
平日更新
10. Outline
1. PubMedの概要と検索サイト
2. 論理演算⼦の利⽤と検索例
◦ 論理演算⼦と検索式
◦ 検索式を⽤いた検索の例
3. タグを利⽤した検索
◦ タグの使い⽅
◦ タグを⽤いた検索の例
4. MeSH DatabaseとAdvanced Search Builder
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12. AND検索(論理積)
•指定した語が全て含まれるものを抽出
•連続して出現するものだけとは限らない
•つかいかた
• A AND B
• ⼀部のサービスでは A & B でもOK
• 語の間にスペースを⼊れると⾃動的にAND検索だが…
• PubMedの場合,よくある語は完全⼀致(フレーズ)検索になる
• どれがフレーズ認識されるかされないか実はよく知らない
• e.g. vaccine AND immunity
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A B
15. AND/OR/NOTの併⽤
•特に指定しない場合の優先順位
1. OR
2. AND
3. NOT (AND NOT)
•順位を指定したい場合は( )を⽤いる
• ミスを防ぐために明⽰的に書くことを推奨
• 算数の計算と同じで( )内が優先処理される
• e.g. ((A AND B) OR C) NOT D
AかつB,またはCのうち,Dを含まないもの
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16. 検索語としてのAND/OR/NOT
•and, or, notを検索語として扱う場合
• これらが単独で検索対象になることはまずない
• 論⽂のタイトルなどを検索する時に使う
• andなどを含む語を “ “ で囲って検索
(完全⼀致検索;後述)
• 論理演算⼦と組み合わせて利⽤可能
•つかいかた
• ”obstetrics and gynecology” OR OBGYN
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18. 前⽅⼀致検索
•中間・後⽅とあわせて「あいまい検索」とも
• * を使う
• *より前にある⽂字列が⼀致する語を抽出
1. 語形・語尾の変化に対応する場合
◦ e.g. cardio*
2. なんとなく覚えているものを調べる場合
• 論⽂名や著者名など
• 前半の⼀部が分かっていれば検索可能
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21. その他の検索での注意点
•α,βは alpha, betaと⼊⼒
• 2010年9⽉以降のデータはギリシャ⽂字に対応
•ローマ数字は全て⼩⽂字
• Ⅰ,Ⅱはⅰ,ⅱとする
•-(ハイフン)はスペースに変換
• 後述のタグで⽤いる場合を除く
• ?や%は省略して⼊⼒
•温度は37℃ではなく 37 degrees C とする
212017/04/24 © 2017 TAKANORI HIROE; DEPARTMENT OF BIOSTATISTICS, KYOTO UNIVERSITY SCHOOL OF PUBLIC HEALTH
22. Outline
1. PubMedの概要と検索サイト
2. 論理演算⼦の利⽤と検索例
◦ 論理演算⼦と検索式
◦ 検索式を⽤いた検索の例
3. タグを利⽤した検索
◦ タグの使い⽅
◦ タグを⽤いた検索の例
4. MeSH DatabaseとAdvanced Search Builder
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24. PubMedの検索⽤タグ⼀覧
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引用:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/#pubmedhelp.How_do_I_search_PubMed
26. [AU]関連
•Author
• [1AU]はFirst Author
• [FAU]は全員(2002年以降;掲載者のみ)
• [LASTAU]はLast Author
•原則として「名+性のイニシャル」
• ⽇本⼈の場合は逆も多いので両⽅で探す
•e.g. kamiya t[AU]
toru k[1AU]
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28. [DP]
•Publication Date
• 特定の年,⽉,⽇または期間を指定可能
• yyyy/mm/dd[DP]
•e.g. 2015[DP]
2010/01:2013/12[DP]
“last 5 year”[DP]
(days, monthsもOK)
282017/04/24 © 2017 TAKANORI HIROE; DEPARTMENT OF BIOSTATISTICS, KYOTO UNIVERSITY SCHOOL OF PUBLIC HEALTH
34. ドメインの種類と⽤途
ドメイン(TLD, SLD) 主な用途
.jp(国別ドメイン)/.gb/.tv/.to etc. 当該国の関係者もしくは法人
.go.jp 日本政府
.co.jp 日本で登記されている法人
.or.jp 財団法人・社団法人・医療法人など
.ne.jp ネットワークサービス事業者
.ac.jp / .ed.jp 日本の教育機関・学術研究機関
.edu 主に米国の高等教育機関
.gov 米国の政府機関(.usはほとんどない)
.pro 専門職(資格証明が必要)
そのほか,.com/.net などは目的や用途を問わず利用可能
342017/04/24 © 2017 TAKANORI HIROE; DEPARTMENT OF BIOSTATISTICS, KYOTO UNIVERSITY SCHOOL OF PUBLIC HEALTH
37. PMID/DOI
•PMID: PubMed Unique Identifier
•doi: Digital Object Identifier
372017/04/24 © 2017 TAKANORI HIROE; DEPARTMENT OF BIOSTATISTICS, KYOTO UNIVERSITY SCHOOL OF PUBLIC HEALTH
PMID/doi は
小さく書いてある
38. Outline
1. PubMedの概要と検索サイト
2. 論理演算⼦の利⽤と検索例
◦ 論理演算⼦と検索式
◦ 検索式を⽤いた検索の例
3. タグを利⽤した検索
◦ タグの使い⽅
◦ タグを⽤いた検索の例
4. MeSH DatabaseとAdvanced Search Builder
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46. MeSH Database(5/6)
462017/04/24 © 2017 TAKANORI HIROE; DEPARTMENT OF BIOSTATISTICS, KYOTO UNIVERSITY SCHOOL OF PUBLIC HEALTH
Add to Search
Builderで検索式が
自動生成されたら
“Search PubMed”